Definizione: Una cover è una canzone che originariamente è stata eseguita da un artista ed un altro gruppo (la cover band) decide di riprenderla e suonarla nella propria versione.

Canzoni che sono state interpretate dai Pumpkins e che appaiono sulla discografia ufficiale sono queste:

Titolo della canzone	Interprete originale	Dove trovarla
Clones (We're All)	Alice Cooper	TAFH box set
Dancing in the Moonlight	Thin Lizzy	Singolo di Disarm (Heart)
Destination Unknown	Missing Person	TAFH box set
Dreamin'	Blondie	TAFH box set
Girl Named Sandoz	The Animals	Peel Sessions, PI
Jackie Blue	Ozark Mtn Daredevils	K-Tel compilation
Landslide	Fleetwood Mac	PI, Disarm (Heart)
My Blue Heaven	Whiting/Donaldson	Singolo di 33, TAFH box set
Never Let Me Down Again	Depeche Mode	Singolo di Rocket
A Night Like This	The Cure	TAFH box set
Rudolph the Red-Nosed Reindeer	canzone tradizionale	Kevin & Bean comp. cassetta
Sad Peter Pan	Vic Chestnutt	Sweet Relief II comp.
Terrapin	Syd Barrett	I Am One 10" vinile
You're All I've Got	The Cars	TAFH box set

Transmission [Joy Division], Boys Don't Cry [The Cure], Godzilla [Blue Oyster Cult], Out of Focus [Blue Cheer], ed un pò Sunshine of Your Love [Cream] possono essere trovati sui Cd bootlegs così come Rudolph the Red-Nosed Reindeer.
Le Performances di "Auf Wiedersehen", "Baby Loves to Rock" e "If You Want My Love" eseguite con i Cheap Trick sono recuperabili dai vari bootlegs tratti dal concerto pre-MCIS del 23/10/95.
Nel concerto di apertura per il concerto dei KISS nell'Halloween 1998, la band era travestita da Beatles e cominciò l'esibizione con la cover di "Money(That's What I Want)".
Al Bridge School Benefit del 1999, Billy ha cantato "Stay" degli U2, e James ha cantato "'Ol 55" di Tom Waits.